《波斯王子3：王者无双》是设定在《时之沙》之后的故事，讲述波斯王子与爱人Kaileena从时之岛回到了巴比伦。岂料巴比伦如今正发生战争，而波斯王子则被视为敌人。由于波斯王子被逮捕，Kaileena无奈之下只有再度使用时之沙，希望救回王子、虽然王子获救，却也因此成为逃犯，被全国通缉。
　　更加糟糕的时，王子发现过去的战斗令他的体内产生了邪恶的灵魂的波斯王子。阴暗王子的出现让育碧公司加入了一个双人游戏模式。光明王子看起来与阴暗王子明显不同，更象是时之沙中长大后的王子。依然敏捷技能出众，这不大的双刃武器更他更加诡异多变。他可以双手持刀，投掷其一，或双刀作战。阴暗王子不仅外表更暗，发光的眼睛，阴冷的服装。动作也更富于侵略性，随时准备给予人类致命一击。
在POP3中，善恶两极化的设计取代了前作的时空转换，而随着剧情的发展，游戏中会出现正义和邪恶两位王，如人物造型、力量、战斗技巧、所属武器、地形作战等等，正义王子在造型上与前作相同，擅长在屋顶和平地作战，依然以时之匕首为主要武器！
　　作为近年来最出色的动作游戏，“波斯王子”系列又即将在今年感恩期间推出第三部——《波斯王子3王者无双》（Prince of Persia The Two Thrones，后文简称POP3），它依然由Ubisoft Montreal来负责开发。

　　“时之砂三部曲”

　　在前作中，王子杀死了时间守护者DAHAKA，再次改变了自己的命运，但也不可避免地改变了他人的命运，从前作结尾的CG可看到，巴比伦燃起了熊熊大火，一名女子被绑在木架上，这也暗示着游戏故事并没有结束。在POP3中，剧情承接着前作，王子带着凯琳娜（Kaileena）离开了时之岛，返回喧嚣繁华的故乡——巴比伦，原以为能过上和平幸福的生活，当他们回去后才发现一切都变了，巴比伦遭受战争的蹂躏，王子也受到了臣民的敌视，并被他们抓住囚禁在大牢中，为了拯救王子，凯琳娜决定牺牲自己来释放时之砂，试图改变现状。与前作一样，释放时之砂带来的结果会有两面性，王子顺利逃出大牢，虽然成为了通缉犯，但无数血腥战斗使他身上产生了邪恶的一面，随着时间的推移，邪恶灵魂渴望血腥杀戮的本性逐渐苏醒，并渐渐吞噬原本代表正义的王子的灵魂，王子不仅要避开臣民的追捕，挽救失落的巴比伦，还要抵抗“邪恶王子”的控制。

　　在剧情叙述方面，POP3将与前两作不同，它更强调无意中听到的谈话，因此在游戏中，王子经常躲在角落里偷听别人的秘密交谈，并通过这些谈话内容来推动剧情的发展。叙述方式的改变应当归功于忠实的Fans，他们经常在官方论坛上发表自己的意见，有人提出不断的时空转换会让思维错乱，残忍和血腥屠杀并不是王子的本性，制作组则根据这些反馈来重新设定游戏，加上前两作的制作经验和突出特性，因此玩家会看到一个更为合理的POP3。另外，POP3将是“时之砂三部曲”的完结篇，但它只是结束关于时之砂的所有故事，并不代表“波斯王子”系列就此终结。